城市违章建筑的分类和处理方式如下：
程序违建
定义：程序违建是指建筑物本身并未违反城市规划，但在建设过程中存在程序瑕疵，例如未申请或获得必要的建设工程规划许可证。
处理方式：可以通过补办手续合法化。在符合规划的前提下，程序违建通常无需强制拆除，而是可以限期改正并补办手续。违建当事人需要承担5%至10%的罚款。
实质违建
定义：实质违建是指建筑本身违反了城市规划的基本要求，即使后续补办手续，也无法使其合法化。
处理方式：通常只能限期拆除。对于确实无法拆除的，主管部门可以没收实物或违法所得，并处10%以下的罚款。
具体处理步骤
查明事实阶段
查清违章建筑形成的时间、原因、结构、面积、用途，是否存在民事纠纷，是否存在同时违反两个以上的行政法律规范的情形，是否已经行政执法机关查处等。
处理和处罚阶段
分类分流：根据违章建筑的时间界限和是否违反多个行政法律规范进行分类分流。
作出决定：根据处理或处罚决定分别处置，对补办手续的，进入补办手续阶段；对处以没收或限期拆除的，进入执行阶段。
补办手续阶段
对于依法应当直接补办手续或经过处罚后要求补办手续的，由违章建筑的当事人到相关行政部门补办手续。
签定安置补偿协议阶段
由拆迁双方自行确定安置补偿方案。对协商不成的，经一方当事人申请可进入行政裁决阶段；对达成协议后，被拆迁人拒不履行的，经拆迁人申请，可进入强制拆迁阶段，由人民法院依法强制执行。
行政裁决阶段
对拆迁当事人经协商未能达成协议，经一方当事人的申请行政裁决的，行政机关应予受理。行政机关在查明事实的基础上，在法定期限内就安置补偿作出行政裁决决定，并明确当事人搬迁的期限。
费用承担
违章建筑不仅要被拆除，违建当事人还要承担拆除违建所花费的全部费用。法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百八十八条。
强制拆除违法建设费用由当事人承担。例如，《北京市城乡规划条例》和《武汉市控制和查处违法建设暂行办法》均有相关规定。
建议
及时补办手续：对于程序违建，当事人应尽快补办相关手续，以避免进一步的法律责任。
积极配合调查：在处理过程中，当事人应积极配合相关部门的调查，提供必要的信息和证据。
寻求专业法律帮助：当事人可以寻求专业律师的帮助，以便更好地了解自身权利和义务，合法合规地处理违章建筑问题。